乱斗西游的元神系统是游戏内提升角色战斗力的核心玩法之一，玩家需要达到40级才能解锁该功能。开启后默认初始境界为一重神宵境·初，通过修炼或使用凝神果获取修为值，每日最多可修炼三次。元神系统包含九大境界，每个大境界分为初、中、上三个小境界，每次提升都会增加生命值和转化强度属性，后者会根据英雄类型转化为相应比例的物理或法术强度加成。
进入每个大境界时会开启一个灵窍，灵窍内含有三个灵孔，分别在达到初、中、上小境界时解锁。玩家可以向灵孔中镶嵌魂印来获得额外属性，魂印还能为灵窍增加日芒、月华、星辉三种灵值。每个灵窍有六条特技，需要满足特定灵值条件才能激活生效。魂印主要通过灵天探魂玩法获取，也可以通过合成功能将低品级魂印合成为更高品级的魂印。
当元神达到五重景宵境·初后，将解锁元神技能功能。玩家可将符合条件的英雄设置为元神英雄，系统会自动指定其一个技能作为战阵中所有英雄共享的元神技能。需元神技能有共用冷却时间，召唤出的元神英雄仅会释放指定技能后立即离场，其效果与元神属性相关而与英雄自身属性无关。设置元神英雄需满足不在战阵中、等级70级、星级5星、飞升7级等条件。
元神强化是提升属性的重要途径，使用魂晶进行强化时存在成功率和失败惩罚机制。蓝魂晶适用于0-4级强化，紫魂晶适用于2-7级，金魂晶适用于5-7级。强化失败时会根据当前等级返还材料并获得晶砾，晶砾可用于将下次强化成功率提升至100%。境界提升，玩家还能逐步解锁更高品级魂印的合成功能，最高可合成金色品质魂印。
元神系统的培养需要长期规划，建议根据主力英雄的职业特性选择对应的属性加成方向。物理输出型英雄优先提升攻击相关属性，法术型英雄侧重法术强度加成，防御型英雄则需注重生命值和减伤属性。合理搭配灵窍特技和魂印组合能显著提升战斗效率，但需注意资源分配的优先级，避免过度消耗在非主力英雄上。
