要让口袋妖怪火红进入第二周目，首先需要完成一周目的全部主线剧情并击败四天王和冠军。通关后系统会自动存档，这时候咱们会回到自己家。接着大木博士会主动上门拜访，如果图鉴收集数量超过60种，他会帮咱们升级为全国图鉴模式。这时候别急着去精灵联盟，因为冰系天王科拿已经外出旅游，四天王暂时无法挑战。
接下来需要前往一之岛，在精灵中心会遇到之前修理机器的工作人员，得知需要红蓝宝石才能修复设备。咱们得去灯火山寻找红宝石，沿着山路往右走会遇到两个火箭队残党，击败他们后进入山洞深处就能找到红宝石。记得把红宝石带回给工作人员，他会告诉咱们还需要另一块蓝宝石，同时给彩虹通行证，这样就能自由穿梭七岛之间了。
拿到彩虹通行证后，咱们要去四岛找冰系天王科拿。在她家右侧的冰洞里有大瀑布，需要使用攀瀑技能才能上去。在洞穴深处会发现科拿正在和火箭队对峙，帮她解决敌人后会得知火箭队下一个目标是五岛。这时候咱们得赶快前往五岛，在空地上击败几个火箭队小兵后会发现他们的仓库，但需要密码才能进入。
最后一步是去六岛的标记森林，穿过森林后到达变化洞穴，在洞穴深处按特定顺序掉进洞里就能找到蓝宝石。不过刚拿到就会被跟踪的NPC抢走，但他会留下火箭队仓库的密码。回到五岛输入密码进入仓库，在右上角找到那个NPC并击败他，就能拿回蓝宝石。把蓝宝石带回一之岛交给工作人员，设备就修复完成了，这时候二周目的全部内容就正式解锁，可以开始新的冒险了。
完成这些步骤后，咱们就能在七岛之间自由探索，挑战训练师塔，捕捉三神鸟等传说宝可梦。记得在冒险过程中多和NPC对话，他们会提供有用的线索。二周目的难度会比一周目高不少，建议提前准备好强力的队伍再开始新的旅程。
