化石复活需要在特定地点完成。首先需要获取化石，化石可通过月见山深处击败火箭队研究员后二选一获得（左为化石盔化石，右为菊石兽化石），或在尼比市博物馆右侧被树挡住的房屋内与研究人员对话获得神秘琥珀。队伍需预留空位才能携带化石。
复活化石需前往红莲岛的宝可梦实验室。该实验室位于红莲岛精灵中心右侧，进入最右侧房间与研究员对话即可将化石复活为对应宝可梦。神秘琥珀会复活为化石翼龙，化石盔化石复活为化石盔，菊石兽化石复活为菊石兽。复活过程不可逆，需谨慎选择化石种类。
若需捕捉现成的化石宝可梦，冠军之路存在野生化石翼龙、化石盔等化石类宝可梦，但遭遇概率较低。此方法无需复活流程，但需要消耗更多时间进行遭遇和捕捉。化石复活后获得的宝可梦等级固定为20级，个体值随机生成。
需先击败枯叶市马志士获取橙色徽章，才能使用居合斩砍断尼比市博物馆右侧的树木；获得红莲岛通行权限需完成彩虹游戏中心火箭队事件。建议在获得冲浪技能后再前往红莲岛，以避开不必要的路线回溯。
化石类宝可梦在战斗中具有独特优势。化石翼龙作为岩石/飞行系，速度种族值较高；化石盔与菊石兽进化后分别成为镰刀盔与多刺菊石兽，前者侧重物理攻击，后者擅长特殊防御。根据队伍构成需求选择化石种类更为合理。
